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原位雜交是指將特定標記的已知順序核酸為探針與細胞或組織切片中核酸進行雜交，從而對特定核酸順序進行精1確定量定位的過程。原位雜交可以在細胞標本或組織標本上進行。
原位雜交的特點是雜交在顯微鏡載玻片上中期染色體標本上進行。所謂原位即指標本上DNA原位變性，在利用放1射性或非放1射性標記的已知核酸探針雜交后，通過放1射自顯影或非放1射性檢測體系來檢測染色體上特異DNA或RNA順序，可用放1射性顆粒在某條染色體的區帶出現的頻率或熒光的強弱來確定探針的位置，從而進行準確的基因定位。
熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization，FISH）是在20世紀80年代末在性原位雜交技術的基礎上發展起來的一種非性分子細胞遺傳技術，分子病理技術服務，以熒光標記取代同位素標記而形成的一種新的原位雜交方法，探針首先與某種介導分子（reporter molecule）結合，雜交后再通過細胞化學過程連接上熒光染料[1，2].FISH的基本原理是將DNA（或RNA）探針用特殊的核苷酸分子標記，然后將探針直接雜交到染色體或DNA纖維切片上，再用與熒光素分子偶聯的單與探針分子特異性結合來檢測DNA序列在染色體或DNA纖維切片上的定性、定位、相對定量分析.FISH具有安全、快速、靈敏度高、探針能長期保存、能同時顯示多種顏色等優點，不但能顯示中期分裂相，還能顯示于間期核.同時在熒光原位雜交基礎上又發展了多彩色熒光原位雜交技術和染色質纖維熒光原位雜交技術.
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